Þar sem Tomato Brown Rugose Fruit Virus smitar tómata- og piparplöntur um allan heim eru fræfyrirtæki að vinna að ræktun ónæmrar tómatar.
Ríkar erfða- og erfðaauðlindir voru í boði fyrir tómataræktendur jafnvel áður en erfðaefnisrannsóknarverkefni tómatarins hófust. Stórt söfnun tómata í sýkla hefur verið stofnað á nokkrum stöðum. Meira en 75,000 inngöngur í tómötum eru varðveittir í ættum um allan heim. Einn sá stærsti er USDA genebank í Genf, NY.
Röðun tómata erfðamengisins var hafin árið 2005 sem fjölþjóðlegt átak milli 14 landa og lauk árið 2012. Þessum viðleitni hefur verið hraðað mjög með beitingu gervigreindar, vélanáms og háþróaðra reiknirita til að greina mikið magn erfða- og svipgerðargagna.
Tómatapanamengi
Vísindamenn frá Boyce Thompson stofnuninni árið 2020 bjuggu til hágæða viðmiðunargenamengi fyrir villta tómata til að framleiða fullkomnara og gagnlegra tómata-erfðaefni. Þeir uppgötvuðu hluti erfðamengisins sem liggja til grundvallar ávaxtabragði, stærð og þroska, streituþoli og sjúkdómsþoli. Þakkir að hluta til framúrskarandi raðgreiningartækni sem getur lesið mjög langa DNA hluti, viðmiðunargenamengið er fullkomnara og nákvæmara en núverandi gagnagrunnur.
Eldri raðgreiningartækni sem les styttri DNA-hluti greinir stökkbreytingar á eins basastigi. Samt sem áður eru þeir ekki góðir í að finna byggingarafbrigði eins og innsetningar, eyðingar, hvolf eða afrit af stórum DNA-bútum.
Árið 2019 smíðaði alþjóðlegur hópur vísindamanna tómata-erfðamengi með erfðamengisröðum úr 725 fylkjandi og landfræðilega dæmigerðum afbrigðum. Þessi gagnagrunnur inniheldur 4,873 gen sem ekki finnast í upphaflegu viðmiðunargenominu. Núverandi / fjarverandi afbrigðagreiningar leiddu í ljós verulegt genatap og ákaflega neikvætt úrval af genum og hvatamönnum við tómatmyndun og endurbætur.
Lestu greinina í heild sinni á www.seedworld.com.